Megállapodás munkabér készpénzben történő kifizetésére

Tisztelt Szakértő! Munkaügyi ellenőrzés kapcsán eljárást indítottak a cég ellen, mert azon dolgozók, akik részére a bér készpénzben kerül kifizetésre, nem rendelkeztek erről szóló megállapodással (2012. évi I. törvény158. § (1) ). Több területet felülvizsgáltak az új munka törvénykönyve kapcsán, de akiknél a munkaviszony az új munka törvénykönyve hatályba lépését megelőzően kezdődött, valóban nem került erről szóló megállapodás aláírásra. Kérdésem, hogy valóban helytelenül jártak el?