Webshop hibás számlázás

Tisztelt Szakértő! Egy könyvértékesítéssel foglalkozó kft. esetében programhiba miatt a szállítási díj áfamentesen került számlázásra egy negyedév során, nagyjából 400 kimenő számlát érintően. A hiba észlelése után be lett állítva az 5 százalék áfa, de kérdésünk, hogy a már kiállított számlák esetében mi a helyes eljárás? A vevők 99 százalékban magánszemélyek, az áfát a bruttó szállítási költségből számolnánk vissza, mivel ezt már a vevőink nem tudják megfizetni. Az áfa bizonylatolása és önellenőrzése történhet egy jegyzőkönyv alapján? Mit tudnának javasolni, hogy legegyszerűbben lehessen kezelni ezt a problémát? Válaszukat köszönöm!