Külföldi telephely létesítésének számlázása

Tisztelt Szakértő! Segítséget kérnénk a következő kérdésben. Van egy cégünk, aki Szlovéniában végez beruházást (új gyártócsarnok építés), szlovén adószámmal rendelkezünk, valamint kinti székhelyszolgáltatásunk van. Magyar kft. a fővállalkozó (nincs kinti adószáma), azonban a csarnok építésének kivitelezését átadta egy magyar alvállalkozónak, akinek van kint adószáma. Azonban a kivitelezési munkát a fővállalkozó számlázná ki nekünk áfamentesen és az Áfa tv. 39. §-ára hivatkozik. Kérdésünk, hogy a számlázás helyesen történik-e így, illetve nekünk mint befogadónak hol kell szerepeltetnünk az áfabevallásban ezt a számlát? Köszönettel.