Gyes mellett egyéni vállalkozó

Tisztelt Szakértő! Egy gyeden lévő anyuka egyéni vállalkozó lett (szja-s). A régi munkahelyén természetesen nem szűnt meg a munkaviszonya. Az rendben van, hogy gyed alatt nem kellett járulékokat fizetnie, azonban 2 éves lett a gyermek, ezért ugye gyes mellett meg kell fizetni a garantált bérminimum utáni járulékokat. A bérprogram azonban mégsem számolja. Ha 20 ezer forintot számfejtek neki, akkor csak az után számolja a járulékokat. Mellékfoglalkozású vállalkozóként van nyilvántartva. A bérprogramban a jogcímkódja: gyes folyósítása melletti munkavégzés, és az alkalmazás minősége a '08-as bevalláson pedig egyéni vállalkozó (36 órát elérő munkaviszony mellett), mivel az eredeti munkahelye még megvan, csak gyesen van. Valamit nem jól állítottam be valószínűleg, de nem jövök rá, mi lehet az. Nagyon köszönöm a segítséget.